언더우드와 아펜셀라 선교사의 입국과 함께 미 복장로교와 감리교가 이 땅에 들어온 이후 1897년까지 장로교의 호주 카나다 및 성공회 침례교 등 7개의 새 선교단체가 들어오게 되었다. 이에 따라 각 교파 선교사가에 협력의 필요성을 느껴 1889년에 처음 조직된 것이 미 북장로교와 호주 장로교 사이의 "연합 선교 공의회(The United Concil of Presbyterian Missions)" 였다. 그러나 호주 선교부의 유일한 선교사이던 데이비스(J.H.Davies)의 죽음과 함께 공의회는 중단될 수밖에 없었다.

  그 후 1893년 1월28일 미남북 장로교 한국 선교부는 사업이 중복과 지역의 중첩을 피하기 위하여 "장로교회 치리 기구 준행 선교부 공의회(The Council of Missions holding the Presbyterian Form of Goverment)"를 조직하였는데 나중에 카나다 장로교와 호주 장로교도 여기에 가입하였다.

  이 선교부 공의회의 첫 번째 회의에서 소위 "교계 예양"(敎界禮讓) 이라 일컫는 선교지 분할 협정이 맺어졌다. 이 선교사 공의회는 2기로 나누어지는데 1기는 선교사 공의회시대(1893~1900)로 선교사만이 회원이 되었고 2기는 합동 공의회 시대(1901~1906)로 선교사와 한국인 총대가 함께 회원이 되었다.

 


   1907년 9월17일 오전 9시에 선교사 공의회의 결정에 의하여 대한 예수교 장로회 노회(독노회)가 평양 장대재 예배당에서 조직되었다.

   이 때 회원은 3선교부 (미남북, 호주, 카나다) 목사 33인, 한국인 장로 36인이었으며 임원은 회장 마포 삼열, 부회장 방기창, 서기 한석진, 부서기 송린서, 회계 이길함이었다.

   제 1회 노회는 장로회 신학교 1회 졸업생인 서경조. 방기창, 이기풍, 길선주, 송린서, 양전백, 한석진 7인을 시취 안수하므로 이들이 한국 장로교 최초의 목사가 되었으며 그 중 이기풍 목사를 제주도 선교사로 파송하기로 결의하였다. 또한 신경(12 신조)과 정치(대한 예수교 장로회 규칙)를 1년만 채용하기로 결의하였다(그 후 제2회 노회에 서 채택하기로 결의하였다).

   대한 예수교 장로회 노회 산하에는 경충, 평북, 평남, 황해, 전라, 경상, 함경 등 7대리회가 있었으며 이 때 교세는 교회수 785, 세례교인 18,061명, 목사 49명, 장로 47명, 조사 160명, 교인 총수 72, 968명이었다.

 

    제 5회 노회가 1911년 9얼 17일 대구 남문안 예배당(현 대구제일교회)에서 모여 192년 9월 첫 주일에 총회를 모이도록 결의하고 7대리회는 1912년 3월 1일 안으로 노회를 조직토록 하였다.

   각 대리회의 노회 소집책은 평북 노세영, 평남 주공삼, 황해 이원민, 경기 원두우, 전라 김필수, 경상 왕길지, 함경부두일이었다.

   이리하여 1912년 9월1일 오전 10시 30분에 "예수교 장로회 조선 총회"가 평양 경창문(景昌門)안 여성 경학원에서 역사적인 창립총회를 열었다. 회원은 목사 96명(한국인 52명, 외국인 44명) 장로 125명 총 221명이었다. 임원은 회장 원두우, 부회장 길선주, 서기 한석진, 부서기 김필수, 회계 방위량, 부회계 김석창이었다.

   민경배 교수는 총회조직의 중요한 역사적 의의로
   ① 총회의 전국성
   ② 선교 교회로서의 사명 확인
   ③ 세계 교회와의 연대 의식 강화
   ④ 총회 고퇴의 제정
   ⑤ 사단 법인의 조직 추진
   ⑥ 목사와 장로가 헌법상 "장로" 라는 정신의 구체적 실현
   ⑦ 도덕적 훈련과 교회 치리의 철저한 실현
   ⑧ 학교 교육에 대한 깊은 관심이라고 했다.